發展局局長黃偉綸公布「明日大嶼」的工程估算，預計動用6,420億元公帑。多名民主派成員質疑政府的估價，議會陣線朱凱廸批評：「這個政府總是千方百計誤導市民」，指政府沒將通脹因素計算在內，按朱凱廸的算法，2025年動工至2035完工時，工程成本已高達10,699億元。
朱凱廸表示，按2018年9月的價格估算2025年才動工的明日大嶼工程，是政府的騙局，過往政府在計算工程開支時，均會列明每年升幅5%的價格調整因素，今次卻沒有列明。按照朱凱廸的算法，2018年的6,420億元在考慮通帳升幅後，已換算成2025年的8,780億元；假設發展局分10年向立法會申請撥款，首8年每年申撥1,000億元、第9年申撥剩下的780億元，按付款當日價格計算，立法會總共須撥款10,699億元，超出政府現時預算逾4,200億元。朱凱廸質疑，政府刻意不將通脹計算在內，是為了將造價凍結在最低水位。
發展局局長黃偉綸稱，未就發展棕地的成本估算，但不一定比填海便宜，下周二會向立法會申請明日大嶼的研究撥款。綠色和平資深項目主任朱江，以赤柱馬坑邨為例反駁，指部分零散棕地可以鄉村式公屋的方式發展，不需要大規模興建基建配套，而政府就棕地發展即將完成兩份可行性研究，卻遲遲不公布，是「有研究，不估算」，填海卻是「未研究，先估算」。
綠色和平透過地理資訊地圖和數碼土地界線圖，分辦全港棕地，發現甲、乙、丙級棕地加上官地共超過800公頃。朱江表示，若只發展其中一半、約400公頃棕地，按照地政總署的收回土地特惠補償率，成本約330億元，即明日大嶼填海的四分之一（交椅洲人工島的填海成本約為1,400億元），料可提供近14萬個單位，如政府不只興建12層樓高的公屋，可興建單位數量更會遠超14萬（交椅洲可提供15萬至26萬個單位）。朱江又指，香港現有約50個非法電子垃圾拆解場充斥棕地，外國進口的電子垃圾有毒、污染環境，政府延遲發展棕地，等於變相縱容非法作業污染新界鄉郊。
公民黨郭家麒引數據指，港珠澳大橋連接路超支55%、中環灣仔繞道超支28%、沙中線工程未完已超支37%，質疑明日大嶼最終造價也會遠超估算，「當米已成炊，將海砂倒落海，返唔到轉頭後，超支都要繼續興建。」郭家麒批評政府刻意壓低工程造價、「報細數」，指今日發展局公布的估算內，未有涵蓋已規劃的十一號幹線，以及預計可能需要的道路或鐵路。郭家麒批評計劃荒謬，以青衣為例，居住人口近20萬，設有多條大橋疏導交通；但東大嶼預計有多達110萬人居住，政府卻只提及兩條連接道路，不足以應付交通需要。
黃偉綸指，東大嶼至少可興建4.5萬個房屋單位，料賣地收入最少可獲7,070億元。公民黨譚文豪斥政府「篤數」、脫離現實，因在未計發展商的建築成本的情況下，每個單位的地價已超過1,500萬元。對於發展局指為免工程超支，將成立「主要項目精英學院」和升格「項目成本管理辦事處」，譚文豪諷刺政府「天真離地」、「說法公然侮辱港人智慧」，又稱只要政府叫停丁屋政策，已可騰出與交椅洲填海面積相近的900公頃土地。
黃偉綸表示，將採用每年有1,500公噸的惰性建築廢料，並以機砂代替海砂以減低填海成本。公民黨陳淑莊反駁，指每年生產並適合填海的建築廢料根本不足夠、機砂會對環境造成破壞，最終仍需購買昂貴的海砂。陳淑莊又質疑政府將「鐵路加發展」作為其中一個融資選項，因為港鐵早已壟斷香港的鐵路市場，不應明益港鐵，但黃偉綸聲言，不一定會交由港鐵管理。
建制派方面，建築、測量、都市規劃及園境界議員謝偉銓，認同黃偉綸稱工程不會掏空政府庫房，「我相信應該有根有據，亦有參考過去相關基建所用的建造費……除非未來建造業有很大變化，否則相距我覺得不會太離譜，不會由六千多億變成超過一萬億元。」謝又指，6,240億元的估算與政府一年的開支相約，比例不算高。
民建聯劉國勳表明會支持撥款，指若6,420億元的估算準確，即使超支兩成、支出達7,000億元，根據政府估算最少可獲7,070億元的收入，相信可達收支平衡。劉表示，發展棕地對新界的交通壓力大，填海可減少收地爭議，因此支持交椅洲的填海工程。
